L’intestin grêle héberge naturellement peu de bactéries : l’acidité gastrique, la motricité intestinale et la valvule iléocæcale, qui sépare l’intestin grêle du côlon, maintiennent cette faible densité. Lorsque ces barrières faiblissent, des bactéries s’y multiplient en excès. Le Collège américain de gastroentérologie définit cette prolifération bactérienne de l’intestin grêle, ou SIBO, comme la présence d’un nombre excessif de bactéries dans l’intestin grêle, à l’origine de symptômes digestifs. Ballonnements, gaz, inconfort abdominal et troubles du transit en constituent les manifestations fréquentes, parfois accompagnées de déficits nutritionnels.

Diagnostic et prise en charge médicale

Les recommandations de 2020 évaluent les méthodes de diagnostic, au premier rang desquelles les tests respiratoires, qui mesurent l’hydrogène et le méthane produits par la fermentation bactérienne, et la culture d’aspirat de l’intestin grêle. Le traitement relève du médecin, qui dispose notamment d’antibiotiques. L’accompagnement nutritionnel intervient en complément, avec un objectif central : comprendre pourquoi les bactéries ont pu s’installer, afin de limiter les récidives.

Probiotiques : un paradoxe apparent

Apporter des bactéries à un intestin déjà trop colonisé semble contre-intuitif. Les données publiées invitent pourtant à reconsidérer cette intuition. Une méta-analyse portant sur 18 études a observé un taux de décontamination de 62,8 % sous probiotiques, significativement supérieur à celui des groupes témoins (risque relatif 1,61 ; IC à 95 % : 1,19 à 2,17), ainsi qu’une baisse de la concentration d’hydrogène expiré et des douleurs abdominales. La prévention du SIBO par les probiotiques, en revanche, n’atteignait pas la significativité.

Deux travaux plus ciblés précisent ce tableau. Une petite étude prospective menée chez des patients atteints du syndrome de l’intestin irritable a observé, avec une association de quatre souches, une réduction de 71,3 % du score de sévérité chez les cinq patients porteurs d’un SIBO, contre 10,6 % chez ceux qui en étaient exempts. Un essai randomisé contre placebo, conduit chez des patients atteints de cirrhose décompensée, a montré la disparition du SIBO chez 80,0 % des patients après trois mois de Saccharomyces boulardii CNCM I-745, contre 23,1 % sous placebo. Ces résultats concernent des populations et des souches précises ; ils rappellent que l’effet d’un probiotique dépend de la souche, et se généralise difficilement.

Restaurer le terrain

La lecture orthomoléculaire s’intéresse aux conditions qui ont permis la prolifération : sécrétion acide de l’estomac, fonctions digestives enzymatiques et biliaires, motricité de l’intestin, qualité de la muqueuse et état nutritionnel cellulaire. Une alimentation transitoirement adaptée en glucides fermentescibles soulage souvent les symptômes, avant une réintroduction progressive qui préserve la diversité du microbiote. La Masterclass 5 de l’Académie, consacrée au microbiote et au système nerveux entérique, approfondit ces approches.

Sources

Pimentel M, Saad RJ, Long MD, Rao SSC. ACG clinical guideline: small intestinal bacterial overgrowth. Am J Gastroenterol. 2020;115:165-178. PubMed

Zhong C, Qu C, Wang B, Liang S, Zeng B. Probiotics for preventing and treating small intestinal bacterial overgrowth: a meta-analysis and systematic review of current evidence. J Clin Gastroenterol. 2017;51:300-311. PubMed

Leventogiannis K, Gkolfakis P, Spithakis G, et al. Effect of a preparation of four probiotics on symptoms of patients with irritable bowel syndrome: association with intestinal bacterial overgrowth. Probiotics Antimicrob Proteins. 2019;11:627-634. PubMed

Efremova I, Maslennikov R, Zharkova M, et al. Efficacy and safety of a probiotic containing Saccharomyces boulardii CNCM I-745 in the treatment of small intestinal bacterial overgrowth in decompensated cirrhosis. J Clin Med. 2024;13:919. PubMed

Texte informatif à visée éducative. Il ne remplace pas l’avis d’un professionnel de santé.